In der Nähe der Stadt Raccoon City in einer alten Villa erwacht in der Dusche liegend die junge Frau Alice. Sie durchstreift zunächst die Räumlichkeiten der Villa, bis sie den versteckten Zugang zum Hive der Umbrella Corporation entdeckt, wo sie von einer Springmine getötet wird. Es stellt sich jedoch heraus, dass es sich bei der Frau um einen Klon von Alice handelte, der als lebende Superwaffe unter der Aufsicht von Dr. Isaacs erschaffen wurde.
Trotz der Vertuschungsmaßnahmen der Umbrella Corporation hat sich das T-Virus binnen weniger Wochen von Raccoon City über ganz Amerika und kurze Zeit später über den gesamten Globus verbreitet. Dabei wurde alles Lebende auf dem Planeten ausgelöscht oder in wandelnde Untote verwandelt, zugleich verwandelten sich die meisten Landschaften in karges Ödland. Nur in wenigen Verstecken leben noch vereinzelt Menschen, die per Funk versuchen mit anderen Überlebenden in Kontakt zu treten, um Hilfe und Proviant bitten.