Nachdem der Hacker Flynn vom skrupellosen Medienmogul Ed Dillinger bestohlen wurde, beschließt Flynn, in Dillingers System einzudringen, um den Diebstahl nachzuweisen. Doch bei seinem Hackversuch trifft er auf das Master Control Program, welches Dillingers System schützt. Das MCP kontrolliert nicht nur den Cyberspace, es ist auch in der Lage sich weiterzuentwickeln. Flynn wird durch das MCP digitalisiert und entführt. Er landet im vom Chaos beherrschten Cyberspace, wo ganz allein die Programme herrschen. Flynns einzige Chance auf Rettung liegt in dem Programm TRON. Gemeinsam wollen sie zum MCP vorstoßen und Dillinger stürzen und damit für Freiheit im Cyberspace sorgen.