Ethan Hunt (Tom Cruise) ist dem "Syndikat" dicht auf der Spur. Einer im Untergrund operierenden Organisation, die sich das Ziel gesetzt hat, die Weltordnung aus dem Gleichgewicht zu bringen. Sie agiert mit bestens ausgebildeten Agenten und scheint in allem immer einen Schritt voraus zu sein. Doch wird der Jäger plötzlich zum Gejagten, nachdem auf Drängen des CIA-Chefs Hunley (Alec Baldwin) die IMF aufgelöst wird. Während Hunt vor der CIA flieht, macht er gleichzeitig unnachgiebig Jagd auf das "Syndikat". Um es jedoch endgültig zerschlagen zu können, benötigt er die Hilfe seiner ehemaligen Kollegen William Brandt (Jeremy Renner) und Benji Dunn (Simon Pegg), die mittlerweile der CIA angehören. Außerdem mischt auch noch die geheimnisvolle Ilsa Faust (Rebecca Ferguson) im Geschehen mit, deren genaue Zugehörigkeit niemand so richtig kennt...