In The Happytime Murders ist die Welt von zwei intelligenten Spezies bevölkert, Puppen und Menschen, wobei die Menschen allerdings klar die Oberhand haben und häufig auf die kleineren Stoff-Lebewesen, mit denen sie den Planeten teilen, herabsehen.
Dann aber erschüttert eine Mordserie die Puppenwelt: Die Cast-Mitglieder der 80er-Jahre-Fernsehserie The Happytime Gang werden nach und nach tot aufgefunden. Daraufhin macht sich ein in Ungnade gefallener Polizist aus Los Angeles, der inzwischen als Privatdetektiv arbeitet, den überreichlichen Alkoholkonsum liebt und selbst eine Puppe ist, daran, die Morde an den nicht-menschlichen Akteuren der Kindershow aufzuklären. Hierfür braucht besagter Phil Phillips allerdings die Hilfe seines menschlichen Ex-Partners der LAPD.